- diena.lt inf.
- Teksto dydis:
- Spausdinti
Pirmosios ir antrosios koronaviruso bangos sukėlėjų atmainos skiriasi. Įmanoma vienu metu užsikrėsti net keliomis koronaviruso atmainomis. Tai – tik keletas pirminių išvadų, paaiškėjusių plataus masto koronaviruso genomo tyrimuose, kuriuos atlieka Lietuvos sveikatos mokslų universiteto (LSMU) mokslininkų grupė.
„Rugsėjo 15 d. tarptautinėje virusų duomenų bazėje LSMU mokslininkų komanda su pasauliu pasidalijo pirmąja Lietuvoje nuskaityta koronaviruso genomo seka. Nuo to laiko LSMU tyrėjai duomenų bazę papildė daugiau kaip 150-ies genomų sekomis iš 5 Lietuvos miestų – tai didžiausios apimties koronavirusų genomų tyrimas Baltijos ir kaimyninėse šalyse“, – sako LSMU prorektorė mokslui profesorė Vaiva Lesauskaitė.
Kas apskritai yra koronaviruso genomas ir kodėl taip svarbu jį tyrinėti? Ar virusas Lietuvoje mutuoja? Kuo skiriasi pirmosios ir antrosios bangos virusai? Šiuos klausimus uždavėme projekto mokslininkams tyrėjams – LSMU doktorantui Lukui Žemaičiui ir Kembridžo universiteto (University of Cambridge) doktorantei, virusologijos skyriaus bioinformatikei Ingridai Olendraitei.
– Kaip renkama informacija apie koronaviruso genomo seką?
Lukas Žemaitis (L. Ž.): Koronavirusai, kaip ir kiti virusai, yra primityvios gyvybės formos, sudarytos iš genetinės medžiagos, ją gaubiančio baltymų sluoksnio ir membraninio apvalkalo. Genetinėje medžiagoje – genome – užkoduotos biologinės viruso savybės. Genomo tyrimai būtini siekiant sukurti vakciną, vaistus ar diagnostinius metodus, jie svarbūs ir molekulinei epidemiologijai, kadangi pagal viruso mutacijų profilį, tarsi pagal unikalų brūkšninį kodą, galima tiksliai atsekti viruso plitimo kelius, ištirti ligos židinius.
Gautas viruso genomo sekas apdorojus įvairiais bioinformaciniais algoritmais, surenkama konkretaus mėginio viruso genomo seka. Koronaviruso atveju ją sudaro apie 30 tūkst. nukleotidų (raidžių RNR kode). Šiame tyrime taikėme dvi skirtingas sekoskaitos technologijas: atlikome DNR sinteze pagrįstą RNR sekoskaitą ir išbandėme inovatyvų nanoporomis pagrįstą tyrimo metodą.
– Ar LSMU mokslininkai buvo pirmieji, paskelbę duomenis iš Lietuvos?
Prof. Vaiva Lesauskaitė (V. L.): Tarptautinėje duomenų bazėje GISAID iki šio laiko buvo paskelbtos tik trys Lietuvoje nustatyto SARS-CoV-2 genomo sekos, kurias nuskaitė Vokietijos mokslininkai. Tačiau LSMU mokslininkai pirmieji pateikė išsamius virusą apibūdinančius duomenis, kurie buvo gauti Lietuvoje.
Tuo pačiu džiugu, kad LSMU tyrėjų komanda ne tik sėkmingai pritaikė skirtingas sekoskaitos technologijas tokio tipo tyrimams, bet ir didžiausiu kiekiu duomenų papildė GISAID duomenų bazę Baltijos regione ir kaimyninėse šalyse (Latvija iki šios dienos yra paskelbusi 135 genomus; Estija – 20; Baltarusija – 3; Lenkija – 117). Tyrimai atliekami LSMU mokslininkams laimėjus Lietuvos mokslo tarybos finansavimą.
Freepik.com nuotr.
– Tyrimo rezultatai sklaido spėliones, esą Lietuvoje plinta „lengvesnė“, „geresnė“ viruso versija. Koks gi tas mūsų šalyje išplitęs virusas?
Ingrida Olendraitė (I. O.): Pirmosios bangos metu Lietuvoje plitęs koronavirusas nuo Wuhano, kuriame prasidėjo pandemija, viruso genomo sekos skyrėsi vidutiniškai septyniais nukleotidais. Tad galima teigti, kad šis, lyginant su kitais virusais, pvz. gripo, mutuoja mažai. Panašius duomenis pateikia ir kiti pasaulio mokslininkai.
Šiandien žinoma, kad užsikrėtusiam asmeniui imuninis atsakas susiformuoja per pirmąsias savaites, tačiau kokio jis stiprumo, kaip ilgai išlieka – nėra vieningos nuomonės.
Palyginę nuskaitytus genomus su užsienio duomenimis, nustatėme, kad viruso variantai, cirkuliavę didžiausiuose pandemijos protrūkio taškuose (Italija, Niujorkas, Wuhanas), pavasarį taip pat sklido ir Lietuvoje.
Todėl negalima teigti, kad Lietuvoje plinta koks nors „geresnis“ virusas. Labiau tikėtina, kad mūsų šalyje jis buvo geriau suvaldytas ir taip smarkiai neišplito. Tai dar kartą parodo, kad svarbiau laiku suvaldyti ligos židinius – o ne tikėtis, kad mūsų genetinis pagrindas ar „geresni“ viruso variantai apsaugos nuo infekcijos.
– Svarbią vietą tyrime užėmė mėginių iš Marijampolės duomenų analizė. Kas paaiškėjo?
L. Ž.: Siekėme įvertinti kovo mėnesį išplitusio koronaviruso židinio Marijampolėje priežastis. Tyrėme, ar židinyje vyravo tas pats virusas, ar tiesiog atsitiktinumas lėmė, kad vienoje vietoje atsirado daug užsikrėtusių asmenų. Iš PGR tyrimų to nustatyti neįmanoma.
Paaiškėjo, kad daugelis tirtų asmenų buvo užsikrėtę tuo pačiu viruso variantu, analogiškų virusų variantų tuo pačiu laikotarpiu radome ir kituose Lietuvos miestuose. Tai rodo, kad viruso protrūkis rajone nebuvo laiku suvaldytas ir nuo vieno atvejo veikiausiai užsikrėtė ne tik daug žmonių Marijampolėje, bet virusas išplito ir už regiono ribų.
– Svarbus tyrimo atradimas: sergantysis šiuo virusu gali užsikrėsti dar kartą. Ar įmanomas tvirtas imunitetas po koronavirusinės infekcijos?
L. Ž.: Viename mėginyje netikėtai radome bent du skirtingus viruso variantus. Tai rodo, kad asmuo, užsikrėtęs koronavirusu, gali juo užsikrėsti ir dar kartą. Tikėtina, kad toks dvigubas užsikrėtimas gali apsunkinti ligos eigą, sukelti didesnes organizmo pažaidas. Tačiau kalbėti apie imuninį COVID-19 infekcijos atsaką dar labai sudėtinga.
Šiandien žinoma, kad užsikrėtusiam asmeniui imuninis atsakas susiformuoja per pirmąsias savaites, tačiau kokio jis stiprumo, kaip ilgai išlieka – nėra vieningos nuomonės. Yra atvejų, kai sirgęs COVID-19 asmuo užsikrėtė antrą kartą. Savo tyrime taip pat vertiname imuninio atsako susidarymo ypatumus, tačiau apibendrintas išvadas skelbti dar anksti.
– Ar pirmosios ir antrosios bangų virusai Lietuvoje skiriasi?
I. O.: Iš visų nustatomų mutacijų itin daug dėmesio sulaukia sparčiai Europoje plintanti D614G mutacija, esanti viruso spygliuko (smaigalio) baltyme. Manoma, kad ši mutacija gali palengvinti viruso kelią į ląstelę. Dar pavasarį atkreiptas dėmesys į Europoje ir Kinijoje plintantį viruso variantą, kuris turi vieną amino rūgšties pokytį: D amino rūgštį pakeičia G amino rūgštimi, ši viruso mutacija sparčiai pradėjo dominuoti Europoje, o vėliau JAV, Kanadoje ir Australijoje.
Kai kuriais eksperimentais buvo parodyta, kad jei virusas turi G amino rūgštį, žmogaus plaučių epitelio ląstelėse viruso buvo nustatoma daugiau, juo buvo lengviau užkrėsti ląsteles (plačiau apie tai – čia). Vis dėlto dėl šios mutacijos reikšmės mokslininkai iki šiol nesutaria.
Mokslininkams dar tikrai yra ką nuveikti, siekiant geriau pažinti šį neprašytą svečią, tad turime telktis ir bendradarbiauti.
Freepik.com nuotr.
Iš mūsų tirtų pirmosios bangos mėginių, D amino rūgšties variantą turėjo 93 proc. mėginių, o galimai lengviau plintančią ir efektyvesnį viruso pasidauginimą lemiančią G mutaciją turėjo vos 7 proc. Lietuvoje tirtų mėginių.
Atlikę antrosios koronaviruso bangos genomo tyrimus, pamatėme, kad situacija apsivertė aukštyn kojomis. Tirtuose antrosios bangos mėginiuose buvo nustatyta šimtaprocentė G mutacija: šis viruso tipas tapo dominuojančiu ir Lietuvoje. Be abejo, ši ir keletas kitų viruso mutacijų patraukė mūsų tyrėjų komandos dėmesį, tad tolesniuose tyrimo etapuose sieksime geriau suprasti jų klinikinę reikšmę.
– Ar atlikę tokio plataus masto tyrimus galite pateikti kokių nors rekomendacijų, prognozių?
L. Ž.: Visi mūsų iki šiol atlikti tyrimai patvirtina svarbią žinią: kol nėra vakcinos, didžiausią dėmesį būtina skirti infekcijos plitimo kontrolei. Šiuo metu vyraujantis antrosios COVID-19 infekcijos bangos viruso tipas gali būti labiau prisitaikęs plisti. Taip pat nustatėme, kad vienas žmogus gali užsikrėsti keliais koronavirusais vienu metu, o Marijampolės protrūkio pavyzdys parodė, kad net vieno atvejo gali pakakti užkrėsti dešimtis žmonių.
Šie faktai tik patvirtina, kad šiandien turime elgtis labai atsakingai, laikytis rekomendacijų ir stengtis kuo greičiau suvaldyti ligos plitimą. Mokslininkams dar tikrai yra ką nuveikti, siekiant geriau pažinti šį neprašytą svečią, tad turime telktis ir bendradarbiauti.
SUSIJĘ STRAIPSNIAI
-
Baltijos šalys bendradarbiaus valdant su sveikata susijusias krizes
Trečiadienį sveikatos apsaugos ministras Arūnas Dulkys Briuselyje pasirašė memorandumą su kitų Baltijos valstybių – Latvijos ir Estijos – ministrais dėl bendradarbiavimo ir savitarpio pagalbos su sveikata susijusių krizių valdyme, ...
-
PSO: per 50 metų skiepai išgelbėjo mažiausiai 154 mln. gyvybių8
Pasaulio sveikatos organizacija (PSO) trečiadienį pareiškė, kad per pastaruosius 50 metų skiepai pasaulyje išgelbėjo mažiausiai 154 mln. gyvybių. ...
-
Skelbiamas Respublikinės Vilniaus universitetinės ligoninės direktoriaus konkursas1
Sveikatos apsaugos ministerija (SAM) paskelbė konkursą Respublikinės Vilniaus universitetinės ligoninės (RVUL) direktoriaus pareigoms užimti. ...
-
NVSC: rudenį dalis gyventojų nuo erkinio encefalito galės pasiskiepyti nemokamai4
Nuo rugsėjo pirmosios 50–55 metų sulaukę asmenys galės nemokamai pasiskiepyti nuo erkinio encefalito, praneša Nacionalinis visuomenės sveikatos centras (NVSC). ...
-
Nacionalinis vėžio institutas rengs mokymus odontologams, kaip gydyti vėžiu sergančius pacientus
Nacionalinis vėžio institutas (NVI), Odontologų rūmai ir Pagalbos onkologiniams ligoniams asociacija (POLA) sutarė dėl bendradarbiavimo gydant vėžiu sergančius pacientus. Pasak specialistų, odontologams dažnai trūksta žinių, kaip gydyti onkologin...
-
Medikai ragina įdiegti kūdikių patikrą dėl imunodeficito, pabrėžia šeimos gydytojų svarbą
Medikai ragina kūdikius tikrinti dėl įgimtų imuninės sistemos sutrikimų, nes tai leidžia visiškai išgydyti imunodeficitą, tuo metu diagnozuojant šią genetinę ligą suaugusiesiems pabrėžia šeimos gydytojų vaidmenį. ...
-
Gali tirti pavojingiausias pasaulio infekcijas: žmonės į procesą praktiškai nesikiša
Panevėžio ligoninėje atsirado galimybė diagnozuoti visas, net pačias pavojingiausias, pasaulio infekcijas. Rekonstravus laboratoriją, atsirado moderniausia aparatūra, visi procesai skaitmenizuoti, tyrimų duomenys sujungti su e.sveikata, todėl gydytoja...
-
Iššokęs pėdos kauliukas: deformacija pašalinama be didelių pjūvių3
„Northway“ inf. ...
-
Prezidentūra palaiko „Invega“ idėją ieškoti papildomų priemonių padėti gynybos pramonės įmonėms3
„Investicijų ir verslo garantijos“ („Invega“) vadovas Dainius Vilčinskas su prezidentu Gitanu Nausėda sutarė, kad reikalingos papildomos priemonės paremti gynybos pramonės įmonių plėtrą. ...
-
Sugrįžusi žiema sujaukė lietuvių sveikatą: per anksti išsitraukėme šortus?3
Sugrįžę žiemiški orai atpūtė atgal ir peršalimus. Apie neįprastą peršalimo sezoną LNK žurnalistas kalbėjosi su „Eurovaistinės“ vaistininke Jovita Alekniene. ...