Kiekvienais metais Lietuvos sveikatos mokslų universiteto gimnazijos gimnazistai kuria darbą – metinį projektą. Visus metus domisi pasirinkta tema, renka medžiagą, analizuoja, tiria, daro išvadas. Mokiniai patys renkasi projekto temą, dalykų mokytojai konsultuoja, o baigiantis mokslo metams, t.y. balandžio mėnesį, atrinkti geriausi darbai pristatomi gimnazijos organizuojamoje „Projektų dienoje“.